南华大学附属第二医院李国庆团队在中科院一区TOP期刊《Microbiology Spectrum》发表研究性论文

近日，南华大学附属第二医院李国庆教授团队在微生物领域核心期刊Microbiology Spectrum（中科院1区Top，IF: 9.04）上发表了题为“Long-Read- and Short-Read-Based Whole-Genome Sequencing Reveals the Antibiotic Resistance Pattern of Helicobacter pylori”的研究性论文（2023 Apr 17;e0452222.doi: 10.1128/spectrum.04522-22.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37067452/）。
幽门螺杆菌（H.pylori）感染是引起消化性溃疡及胃癌的最重要原因，且全球感染率高达50%。近年来幽门螺杆菌耐药率不断上升，且耐药率分布存在地区和人群特异性。在此之前尚无针对本地区的H.pylori的抗生素耐药模式研究。

 
本研究中，李国庆教授团队针对本地区的H. pylori.的耐药性进行了检测（克拉霉素、甲硝唑、左氧氟沙星、阿莫西林、四环素和呋喃唑酮），并将以桑格测序为金标准的Illumina 短读测序方法和基于纳米孔测序长读测序方法在其准确性上进行了比较。
 
研究发现，本中心的幽门螺杆菌对甲硝唑，克拉霉素和左氧氟沙星的耐药率很高（耐药率分别为61.5%、38.5%、27.9%），而对四环素或呋喃唑酮则没有耐药性。这些结果可为本地医生根除幽门螺杆菌的抗生素选择提供一线参考。纳米孔测序是近期开发的一种高效测定全基因组序列的技术，具有高效和便捷两种优势，但测序读取的错误率也相对较高。在这项研究中，比较了纳米孔测序和 Illumina 测序在决定克拉霉素抗性的23S rRNA 基因中单核苷酸变异的准确定，研究者发现尽管有一些错误的发现，但纳米孔测序与 Illumina 测序显示出良好的一致性，表明它是预测克拉霉素抗性的潜在工具。
 
南华大学附属第二医院临床研究中心消化内科实习研究员胡立苗、消化内科研究生曾熙为本文共同一作，消化内科李国庆教授、助理研究员刘罗根博士为本文通讯作者。南华大学附属第二医院消化内科为第一署名单位，该研究由衡阳分子诊断与精准医学重点实验室和湖南省胃癌防治临床研究中心课题支持。
 
南华附二医院脊柱外科团队在TOP期刊《Int J Surg》发表高水平论文
本月，南华大学附属第二医院脊柱外科曹奇主任、肖志宏博士团队在外科学领域顶级期刊《International Journal of Surgery》（JCR一区,IF=13.400）上发表了标题为“Risk Factors for Spinal Epidural Haematoma in Patients Undergoing Spinal Surgery: A Meta-analysis of 29 Cohort Studies”的高水平论文。
该篇论文对脊柱手术患者硬膜外血肿危险因素开展Mate分析。分析纳入29组研究，主要针对脊柱手术后发生脊髓硬膜外血肿这一并发症的相关危险因素展开。通过研究发现，在接受脊柱手术的患者中，脊髓硬膜外血肿的发生与年龄、肥胖、高血压、糖尿病、翻修手术和多节段手术显著相关。该研究的目的是确定脊柱手术后硬膜外血肿的相关危险因素，并根据证据水平对危险因素进行分类，以提醒临床医生对脊髓硬膜外血肿高危人群采取有效的干预措施，控制风险，改善患者预后，提高生活质量。
脊柱外科喜讯频传。近期，肖志宏博士带领骆明江同学对脊柱外科另一常见疾病——腰椎间盘突出症的内镜下切除术术后复发的危险因素进行了分析。该研究结果以标题为“Risk factors for lumbar disc herniation recurrence after percutaneous endoscopic lumbar discectomy: A meta-analysis of 58 cohort studies”，发表在《Neurosurg Review》（中科院3区）杂志上。
针对这一术后最严重的并发症，研究者分析了58组相关研究后，发现其发生与糖尿病、LDH、术者经验显著相关。年龄、吸烟、患者的受教育程度、肥胖和劳动情况也有明显关系。该项研究结果有助于协助临床医生对高复发患者进行提前干预。

南华大学附属第二医院在高水平期刊上发表多篇研究论文
前言：南华大学附属第二院在高水平期刊《Molecular Therapy-Nucleic Acids》和《Infectious Disease and Therapy》上连续发表多篇原创研究论文。
南华大学附属第二医院联合复旦大学附属眼耳鼻喉科医院在该域TOP期刊发表原创研究性论文。我院2020级耳鼻咽喉科研究生韩磊以共同第一作者在TOP期刊Molecular Therapy-Nucleic Acids（中科院一区，IF=10.183） 上发表研究性论文Specific knockdown of Htra2 by CRISPR-CasRx prevents acquired sensorineural hearing loss in mice。 CasRx 是最近发现的最小体积的VI型CRISPR系统成员，为原核生物和真核生物高效、特异性的开展RNA操作提供了一种新的途径。然而，使用CasRx系统的功能恢复在活体研究中开展尚为初始阶段。因此，研究者们试图建立腺相关病毒(AAV)-CasRx指RNA (gRNA)系统来特异性敲低Htra2转录物，以保护小鼠免受氨基糖苷类药物所导致的听力受损。研究者们在体外验证了优化了的gRNA，将其用CasRx包装成单个AAV，并将包装好的AAV注射到由新霉素诱导的听力损失的小鼠中（经听觉脑干反应测试）。研究发现，AAV-CasRx-gRNA介导的小鼠中 Htra2转录物的敲低被证明对于预防由氨基糖苷类诱导的听力损失是有效和安全的，因此为未来用此方法来治疗非遗传性听力受损的应用提供了支持依据。
检验医学研究生曾童以第一作者身份在该领域权威杂志Infectious Disease and Therapy（中科院二区，IF=6.119 ）上发表研究性论文Clinical and microbiological characterization of bloodstream infections caused by Mycoplasma hominis: an overlooked pathogen。该篇论文聚焦国内人型支原体血流感染(BSI)的综合描述，在探索人芽孢杆菌 BSI 的临床特征、耐药性和致病特征的同时，通过血液标本培养，分析抗菌药物敏感情况和喹诺酮类药物耐药情况，为临床合理选用抗菌药物提供依据。基于MLST分析发现8个分离株以CC-6克隆复合体为主，发现发现7个新的序列类型，揭示了与血流感染相关的STs在谱系中的分布。8株分离株与PubMLST数据库中的所有人型支原体菌株进行了比较，鉴定出1个主要克隆复合体和8个单体，揭示了与血流感染相关的STs在谱系中的分布。
南华大学附属第二医院张小团、刘罗根和欧阳靖霖为本研究论文的共同通讯作者。